| Groupe A | 22.08.2016 | Defensor La Bocana | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Groupe A | 25.08.2016 | Deportivo Municipal | - | Juan Aurich | 1:4 |  |
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| Groupe A | 17.09.2016 | Deportivo Municipal | - | Universidad Cesar Vallejo | 2:1 | ||||
| Groupe A | 19.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Unión Comercio | 2:0 | ||||
| Groupe A | 24.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Sporting Cristal | 1:3 | |
Pérou