| 3. Journée | 10.08.2008 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Rijeka | 2:2 |  |
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| 4. Journée | 17.08.2008 | NK Inter Zaprešić | - | NK Croatia Sesvete | 3:2 | |
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| 5. Journée | 24.08.2008 | HNK Cibalia | - | NK Inter Zaprešić | 4:3 | |
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| 6. Journée | 31.08.2008 | NK Inter Zaprešić | - | NK Zadar | 3:1 | ||||
| 7. Journée | 14.09.2008 | NK Varteks | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 21.09.2008 | NK Inter Zaprešić | - | NK Zagreb | 1:1 | |
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| 10. Journée | 05.10.2008 | NK Inter Zaprešić | - | Slaven Belupo | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 19.10.2008 | NK Osijek | - | NK Inter Zaprešić | 2:1 | |
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| 12. Journée | 26.10.2008 | HNK Šibenik | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 | |
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| 13. Journée | 02.11.2008 | NK Inter Zaprešić | - | Dinamo Zagreb | 1:3 | |
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| 14. Journée | 09.11.2008 | HNK Rijeka | - | NK Inter Zaprešić | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 16.11.2008 | NK Croatia Sesvete | - | NK Inter Zaprešić | 1:3 | ||||
| 16. Journée | 23.11.2008 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Cibalia | 1:2 | |
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| 18. Journée | 07.12.2008 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 2:3 | |
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