| 18. Journée | 30.11.2012 | FK Krasnodar | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 07.12.2012 | FK Rostov | - | FK Krasnodar | 2:3 | ||||
| 20. Journée | 08.03.2013 | FK Krasnodar | - | FK Amkar Perm | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 17.03.2013 | CSKA Moskva | - | FK Krasnodar | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 31.03.2013 | FK Krasnodar | - | Anzhi Makhachkala | 4:0 | ||||
| 23. Journée | 08.04.2013 | Mordovia Saransk | - | FK Krasnodar | 0:0 |  |
|||
| 24. Journée | 13.04.2013 | FK Krasnodar | - | Krylia Sovetov | 0:3 | ||||
| 25. Journée | 21.04.2013 | Zenit St. Petersburg | - | FK Krasnodar | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 29.04.2013 | Spartak Vladikavkaz | - | FK Krasnodar | 2:3 | ||||
| 27. Journée | 05.05.2013 | FK Krasnodar | - | Volga Nizhniy Novgorod | 2:0 | |
|||
| 28. Journée | 11.05.2013 | Dinamo Moskva | - | FK Krasnodar | 1:1 | ||||
| 29. Journée | 18.05.2013 | FK Krasnodar | - | Spartak Moskva | 0:1 | ||||
| 30. Journée | 26.05.2013 | Rubin Kazan | - | FK Krasnodar | 2:0 |
Ouzbékistan