| 1. Journée | 28.07.1999 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 3:2 |  |
|||
| 2. Journée | 31.07.1999 | Croatia Zagreb | - | NK Varteks | 4:1 | ||||
| 3. Journée | 28.08.1999 | NK Varteks | - | HNK Cibalia | 0:3 | ||||
| 4. Journée | 07.09.1999 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 18.09.1999 | NK Varteks | - | NK Istra Pula | 4:1 | ||||
| 7. Journée | 25.09.1999 | NK Vukovar 91 | - | NK Varteks | 2:2 | ||||
| 12. Journée | 30.10.1999 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 06.11.1999 | NK Varteks | - | Croatia Zagreb | 0:3 | ||||
| 14. Journée | 23.11.1999 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 3:1 |  |
|||
| 15. Journée | 27.11.1999 | HNK Šibenik | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 18. Journée | 26.02.2000 | NK Varteks | - | NK Vukovar 91 | 2:0 | |
|||
| 19. Journée | 29.02.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:0 | ||||
| 20. Journée | 04.03.2000 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 0:1 | ||||
| 26. Journée | 08.04.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:2 | |
|||
| 27. Journée | 11.04.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 09.05.2000 | Hajduk Split | - | NK Varteks | 0:0 |
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