| 1er tour | 14.09.2000 | FK Krivbas (old) | - | FC Nantes | 0:1 | ||||
| 1er tour | 28.09.2000 | FC Nantes | - | FK Krivbas (old) | 5:0 | ||||
| 2e tour | 26.10.2000 | FC Nantes | - | MTK Hungaria | 2:1 | ||||
| 2e tour | 09.11.2000 | MTK Hungaria | - | FC Nantes | 0:1 | ||||
| 3e tour | 23.11.2000 | FC Nantes | - | Lausanne Sports | 4:3 | ||||
| 3e tour | 07.12.2000 | Lausanne Sports | - | FC Nantes | 1:3 | ||||
| tour des 16 | 15.02.2001 | FC Porto | - | FC Nantes | 3:1 |  |
|||
| tour des 16 | 22.02.2001 | FC Nantes | - | FC Porto | 2:1 | |
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