| 22. Journée | 16.02.2007 | SV Wilhelmshaven | - | 1. FC Union Berlin | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 23.02.2007 | 1. FC Union Berlin | - | Bayer Leverkusen II | 4:0 |  |
|||
| 25. Journée | 10.03.2007 | 1. FC Union Berlin | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 27. Journée | 04.04.2007 | 1. FC Union Berlin | - | Holstein Kiel | 0:2 | ||||
| 31. Journée | 14.04.2007 | 1. FC Union Berlin | - | Fortuna Düsseldorf | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 17.04.2007 | Kickers Emden | - | 1. FC Union Berlin | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 21.04.2007 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Union Berlin | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 28.04.2007 | 1. FC Union Berlin | - | Dynamo Dresden | 2:1 |
Croatie