| 7. Journée | 21.09.2019 | FC St. Pauli [B-jeun] | - | Eintracht Braunschweig [B-jeun] | 2:1 | ||||
| 8. Journée | 28.09.2019 | Chemnitzer FC [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 4:0 | ||||
| 9. Journée | 05.10.2019 | FC St. Pauli [B-jeun] | - | Hallescher FC [B-jeun] | 2:1 | ||||
| 15. Journée | 30.11.2019 | RB Leipzig [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 6:1 | ||||
| 3. Journée | 08.12.2019 | Werder Bremen [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 4:2 | ||||
| 17. Journée | 14.12.2019 | 1. FC Union Berlin [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 3:4 | ||||
| 18. Journée | 15.02.2020 | FC Carl Zeiss Jena [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 1:4 |  |
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| 19. Journée | 22.02.2020 | FC St. Pauli [B-jeun] | - | Hannover 96 [B-jeun] | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 29.02.2020 | Eintracht Braunschweig [B-jeun] | - | FC St. Pauli [B-jeun] | 1:2 | |
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| 16. Journée | 04.03.2020 | FC St. Pauli [B-jeun] | - | Werder Bremen [B-jeun] | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2020 | FC St. Pauli [B-jeun] | - | Chemnitzer FC [B-jeun] | 1:2 |
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