| 7. Journée | 02.09.2012 | FK Krasnodar | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 16.09.2012 | Anzhi Makhachkala | - | FK Krasnodar | 5:2 | ||||
| 14. Journée | 04.11.2012 | FK Krasnodar | - | Dinamo Moskva | 2:0 |  |
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| 15. Journée | 11.11.2012 | Spartak Moskva | - | FK Krasnodar | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 19.11.2012 | FK Krasnodar | - | Terek Grozny | 3:0 | ||||
| 18. Journée | 30.11.2012 | FK Krasnodar | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 07.12.2012 | FK Rostov | - | FK Krasnodar | 2:3 | ||||
| 21. Journée | 17.03.2013 | CSKA Moskva | - | FK Krasnodar | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 13.04.2013 | FK Krasnodar | - | Krylia Sovetov | 0:3 | ||||
| 27. Journée | 05.05.2013 | FK Krasnodar | - | Volga Nizhniy Novgorod | 2:0 |  |
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