| 1. Journée | 28.07.1999 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 3:2 |  |
|||
| 2. Journée | 31.07.1999 | Croatia Zagreb | - | NK Varteks | 4:1 | ||||
| 3. Journée | 28.08.1999 | NK Varteks | - | HNK Cibalia | 0:3 | ||||
| 4. Journée | 07.09.1999 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 18.09.1999 | NK Varteks | - | NK Istra Pula | 4:1 | ||||
| 9. Journée | 12.10.1999 | Slaven Belupo | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 04.12.1999 | NK Varteks | - | HNK Rijeka | 2:1 | ||||
| 25. Journée | 01.04.2000 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 0:0 |  |
|||
| 26. Journée | 08.04.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:2 | ||||
| 27. Journée | 11.04.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 15.04.2000 | HNK Rijeka | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 29. Journée | 24.04.2000 | NK Varteks | - | NK Vukovar 91 | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 29.04.2000 | NK Osijek | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 06.05.2000 | NK Varteks | - | NK Istra Pula | 1:2 |
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