| 5. Journée | 19.09.1999 | Energie Cottbus | - | 1. FC Nürnberg | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 03.10.1999 | Energie Cottbus | - | Chemnitzer FC | 2:4 | ||||
| 11. Journée | 06.11.1999 | Energie Cottbus | - | Karlsruher SC | 3:2 |  |
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| 18. Journée | 13.02.2000 | Fortuna Köln | - | Energie Cottbus | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 21.02.2000 | Energie Cottbus | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 03.03.2000 | Energie Cottbus | - | SpVgg Greuther Fürth | 4:2 | ||||
| 22. Journée | 10.03.2000 | 1. FC Nürnberg | - | Energie Cottbus | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 19.03.2000 | Energie Cottbus | - | Stuttgarter Kickers | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 27.03.2000 | Chemnitzer FC | - | Energie Cottbus | 1:2 | ||||
| 28. Journée | 23.04.2000 | Karlsruher SC | - | Energie Cottbus | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 26.05.2000 | Energie Cottbus | - | 1. FC Köln | 2:0 |
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