| 1. Journée | 29.07.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Sigma Olomouc | 2:1 |  |
 |
||
| 2. Journée | 05.08.2006 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 0:2 | |
|||
| 3. Journée | 13.08.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Viktoria Plzeň | 0:0 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2006 | FK Mladá Boleslav | - | AC Sparta Praha | 3:0 | |
|||
| 6. Journée | 10.09.2006 | FK Marila Příbram | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | |
|||
| 10. Journée | 15.10.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Dynamo České Budějovice | 4:2 | |
|||
| 11. Journée | 23.10.2006 | 1. FC Brno | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | |
|||
| 12. Journée | 29.10.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Slavia Praha | 1:3 | |
Slovaquie