| 6. Journée | 17.09.2016 | KF Shkupi | - | FK Pelister | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 25.09.2016 | FK Pelister | - | Sileks Kratovo | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 28.09.2016 | Vardar Skopje | - | FK Pelister | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 02.10.2016 | FK Pelister | - | KF Shkëndija 79 | 1:2 | ||||
| 10. Journée | 16.10.2016 | FK Pelister | - | FK Pobeda Junior | 2:0 |  |
|||
| 11. Journée | 23.10.2016 | FK Bregalnica Štip | - | FK Pelister | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 16.11.2016 | FK Pelister | - | FK Renova | 1:0 | |
|||
| 15. Journée | 20.11.2016 | FK Pelister | - | KF Shkupi | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 27.11.2016 | Sileks Kratovo | - | FK Pelister | 0:0 | ||||
| 17. Journée | 30.11.2016 | FK Pelister | - | Vardar Skopje | 0:1 | ||||
| 18. Journée | 04.12.2016 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 1:0 |
Joyeux anniversaire! 
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