| 1. Journée | 05.08.2006 | Port Vale FC | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 2. Journée | 08.08.2006 | Leyton Orient | - | Millwall FC | 2:0 | ||||
| 3. Journée | 12.08.2006 | Leyton Orient | - | AFC Bournemouth | 3:2 | ||||
| 4. Journée | 19.08.2006 | Carlisle United | - | Leyton Orient | 3:1 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | Leyton Orient | - | Swansea City | 0:1 | ||||
| 6. Journée | 02.09.2006 | Tranmere Rovers | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 7. Journée | 09.09.2006 | Leyton Orient | - | Brentford FC | 1:1 |  |
|||
| 8. Journée | 12.09.2006 | Bristol City | - | Leyton Orient | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 23.09.2006 | Leyton Orient | - | Rotherham United | 2:3 | ||||
| 11. Journée | 26.09.2006 | Leyton Orient | - | Gillingham FC | 3:3 | ||||
| 12. Journée | 30.09.2006 | Blackpool FC | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 13. Journée | 07.10.2006 | Leyton Orient | - | Chesterfield FC | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 14.10.2006 | Oldham Athletic | - | Leyton Orient | 3:3 | ||||
| 15. Journée | 21.10.2006 | Leyton Orient | - | Cheltenham Town | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 28.10.2006 | Scunthorpe United | - | Leyton Orient | 3:1 |
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