| 22. Journée | 25.01.2014 | RB Leipzig | - | Wacker Burghausen | 0:1 |  |
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| 23. Journée | 01.02.2014 | Wacker Burghausen | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | |
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| 24. Journée | 08.02.2014 | SV Wehen Wiesbaden | - | Wacker Burghausen | 2:1 | |
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| 25. Journée | 15.02.2014 | Wacker Burghausen | - | Holstein Kiel | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 22.02.2014 | SV 07 Elversberg | - | Wacker Burghausen | 1:0 | ||||
| 27. Journée | 01.03.2014 | Wacker Burghausen | - | VfB Stuttgart II | 2:2 | |
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| 28. Journée | 08.03.2014 | VfL Osnabrück | - | Wacker Burghausen | 2:1 | ||||
| 29. Journée | 15.03.2014 | Wacker Burghausen | - | SpVgg Unterhaching | 1:0 | |
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| 31. Journée | 25.03.2014 | Wacker Burghausen | - | Jahn Regensburg | 2:2 | ||||
| 32. Journée | 29.03.2014 | Chemnitzer FC | - | Wacker Burghausen | 1:0 | |
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| 33. Journée | 05.04.2014 | Wacker Burghausen | - | Borussia Dortmund II | 0:0 | ||||
| 34. Journée | 12.04.2014 | SV Darmstadt 98 | - | Wacker Burghausen | 1:0 | ||||
| 35. Journée | 19.04.2014 | Wacker Burghausen | - | Hansa Rostock | 0:1 | |
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| 36. Journée | 26.04.2014 | 1. FC Saarbrücken | - | Wacker Burghausen | 1:1 | ||||
| 37. Journée | 03.05.2014 | Wacker Burghausen | - | Stuttgarter Kickers | 2:0 |
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