| 1. Journée | 20.08.2006 | Atromitos | - | OFI Heraklion | 2:2 | ||||
| 2. Journée | 27.08.2006 | OFI Heraklion | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 3. Journée | 10.09.2006 | Iraklis Saloniki | - | OFI Heraklion | 2:3 | ||||
| 5. Journée | 23.09.2006 | Ergotelis | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 22.10.2006 | Apollon Kalamarias | - | OFI Heraklion | 0:0 | ||||
| 8. Journée | 29.10.2006 | OFI Heraklion | - | Aris Saloniki | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 04.11.2006 | OFI Heraklion | - | AE Lárissa | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 12.11.2006 | AO Kerkyra | - | OFI Heraklion | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 03.12.2006 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||||
| 15. Journée | 17.12.2006 | OFI Heraklion | - | PAOK Saloniki | 1:0 |  |
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