| 1. Journée | 04.08.2012 | FC Kray | - | FC Schalke 04 II | 0:1 | ||||
| 6. Journée | 31.08.2012 | Bor. Mönchengladbach II | - | FC Schalke 04 II | 0:3 | ||||
| 15. Journée | 10.11.2012 | FC Schalke 04 II | - | Fortuna Köln | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 01.12.2012 | FC Schalke 04 II | - | Bayer Leverkusen II | 0:0 |  |
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| 20. Journée | 08.12.2012 | FC Schalke 04 II | - | FC Kray | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 26.03.2013 | MSV Duisburg II | - | FC Schalke 04 II | 0:6 | ||||
| 32. Journée | 19.04.2013 | SC Verl | - | FC Schalke 04 II | 1:3 | |
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| 33. Journée | 26.04.2013 | FC Schalke 04 II | - | 1. FC Köln II | 0:0 | |
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| 35. Journée | 08.05.2013 | FC Schalke 04 II | - | Fortuna Düsseldorf II | 3:1 | ||||
| 38. Journée | 25.05.2013 | Bayer Leverkusen II | - | FC Schalke 04 II | 3:0 | |
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