| 1. Journée | 03.07.2016 | Patriotas FC | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 2. Journée | 10.07.2016 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:0 | ||||
| 4. Journée | 18.07.2016 | Millonarios | - | Alianza Petrolera | 1:0 | ||||
| 11. Journée | 22.07.2016 | Millonarios | - | Once Caldas | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 31.07.2016 | Millonarios | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 11.08.2016 | Millonarios | - | Atlético Bucaramanga | 0:3 | ||||
| 8. Journée | 14.08.2016 | Millonarios | - | Fortaleza FC | 3:2 | ||||
| 9. Journée | 22.08.2016 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 10. Journée | 29.08.2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 1:2 | ||||
| 3. Journée | 06.09.2016 | Deportivo Pasto | - | Millonarios | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 15.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 16.10.2016 | Millonarios | - | Envigado FC | 4:1 |  |
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| 17. Journée | 24.10.2016 | Cortuluá | - | Millonarios | 2:3 |  |
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| 18. Journée | 31.10.2016 | Millonarios | - | La Equidad | 1:2 | ||||
| 15. Journée | 04.11.2016 | Atlético Junior | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 07.11.2016 | Atlético Huila | - | Millonarios | 0:3 | |
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| 20. Journée | 21.11.2016 | Millonarios | - | Independiente Medellín | 3:1 |
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