| 20. Journée | 03.03.2009 | Karlsruher SC II | - | SpVgg Unterhaching II | 0:4 | ||||
| 21. Journée | 07.03.2009 | Viktoria Aschaffenburg | - | Karlsruher SC II | 2:1 | ||||
| 22. Journée | 15.03.2009 | 1. FC Nürnberg II | - | Karlsruher SC II | 2:1 |  |
|||
| 23. Journée | 22.03.2009 | Karlsruher SC II | - | SC Pfullendorf | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 28.03.2009 | SSV Ulm 1846 | - | Karlsruher SC II | 6:1 | ||||
| 16. Journée | 07.04.2009 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Karlsruher SC II | 3:0 | ||||
| 25. Journée | 11.04.2009 | Karlsruher SC II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 1:4 | ||||
| 26. Journée | 17.04.2009 | TSV 1860 München II | - | Karlsruher SC II | 3:0 | ||||
| 28. Journée | 02.05.2009 | SC Freiburg II | - | Karlsruher SC II | 1:0 | ||||
| 29. Journée | 09.05.2009 | Karlsruher SC II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:1 | ||||
| 31. Journée | 17.05.2009 | Karlsruher SC II | - | Eintracht Frankfurt II | 0:2 | ||||
| 32. Journée | 23.05.2009 | SSV Reutlingen | - | Karlsruher SC II | 1:3 |
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