| 14. Journée | 25.02.2024 | Team Südostschweiz [U16] | - | FC Rapperswil-Jona [U16] | 2:2 | ||||
| 16. Journée | 09.03.2024 | Etoile Carouge FC [U16] | - | FC Rapperswil-Jona [U16] | 0:3 |  |
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| 19. Journée | 06.04.2024 | FC Rapperswil-Jona [U16] | - | FC Schaffhausen [U16] | 10:1 | ||||
| 20. Journée | 13.04.2024 | FCO Wil [U16] | - | FC Rapperswil-Jona [U16] | 1:4 | ||||
| 21. Journée | 20.04.2024 | FC Rapperswil-Jona [U16] | - | Team Zürich/Red-Star [U16] | 1:3 | ||||
| 24. Journée | 11.05.2024 | Team Liechtenstein [U16] | - | FC Rapperswil-Jona [U16] | 2:5 | ||||
| 25. Journée | 26.05.2024 | FC Rapperswil-Jona [U16] | - | Team AFF-FFV Fribourg [U16] | 0:4 |
Suisse