| 8. Journée | 26.09.1998 | Arminia Bielefeld | - | Fortuna Köln | 2:1 | ||||
| 9. Journée | 05.10.1998 | Fortuna Köln | - | 1. FC Köln | 4:2 | ||||
| 10. Journée | 18.10.1998 | SpVgg Unterhaching | - | Fortuna Köln | 3:0 | ||||
| 11. Journée | 26.10.1998 | Fortuna Köln | - | Hannover 96 | 3:0 |  |
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| 15. Journée | 20.11.1998 | Fortuna Köln | - | Energie Cottbus | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 29.11.1998 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 17. Journée | 04.12.1998 | Fortuna Köln | - | FC Gütersloh | 3:2 | ||||
| 18. Journée | 11.12.1998 | Fortuna Düsseldorf | - | Fortuna Köln | 2:2 | ||||
| 20. Journée | 28.02.1999 | Stuttgarter Kickers | - | Fortuna Köln | 2:2 | ||||
| 22. Journée | 14.03.1999 | SpVgg Greuther Fürth | - | Fortuna Köln | 4:0 | ||||
| 25. Journée | 11.04.1999 | Fortuna Köln | - | Arminia Bielefeld | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 16.05.1999 | 1. FSV Mainz 05 | - | Fortuna Köln | 1:1 | ||||
| 31. Journée | 23.05.1999 | Fortuna Köln | - | FC St. Pauli | 1:1 | |
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| 33. Journée | 13.06.1999 | Fortuna Köln | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 |
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