| 16. Journée | 11.11.2006 | Rot Weiss Ahlen | - | Holstein Kiel | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 18.11.2006 | Holstein Kiel | - | VfL Osnabrück | 2:0 | ||||
| 18. Journée | 25.11.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | Holstein Kiel | 2:0 | ||||
| 19. Journée | 03.12.2006 | Holstein Kiel | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:2 | ||||
| 20. Journée | 09.12.2006 | Holstein Kiel | - | Dynamo Dresden | 1:0 |  |
|||
| 24. Journée | 03.03.2007 | Holstein Kiel | - | VfB Lübeck | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 10.03.2007 | Werder Bremen II | - | Holstein Kiel | 2:3 | ||||
| 26. Journée | 17.03.2007 | Holstein Kiel | - | Hertha BSC II | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 27.03.2007 | Holstein Kiel | - | SV Wilhelmshaven | 3:1 | ||||
| 29. Journée | 31.03.2007 | Bayer Leverkusen II | - | Holstein Kiel | 4:0 | ||||
| 27. Journée | 04.04.2007 | 1. FC Union Berlin | - | Holstein Kiel | 0:2 | ||||
| 30. Journée | 07.04.2007 | Holstein Kiel | - | Kickers Emden | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 14.04.2007 | FC St. Pauli | - | Holstein Kiel | 2:0 | ||||
| 32. Journée | 21.04.2007 | Holstein Kiel | - | Hamburger SV II | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 06.05.2007 | Bor. Mönchengladbach II | - | Holstein Kiel | 6:1 |
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