| 2. Journée | 06.09.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Tasmania Gropiusstadt [A-jeun] | 1:3 | ||||
| 4. Journée | 20.09.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hamburger SV [A-jeun] | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 28.09.2003 | Bremen 1860 [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 0:2 | ||||
| 6. Journée | 11.10.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hannover 96 [A-jeun] | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 25.10.2003 | Hertha BSC [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 6:1 | ||||
| 8. Journée | 08.11.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | TeBe Berlin [A-jeun] | 0:2 | ||||
| 10. Journée | 22.11.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | VfL Osnabrück [A-jeun] | 1:2 | ||||
| 11. Journée | 29.11.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | Hansa Rostock [A-jeun] | 1:2 | ||||
| 12. Journée | 06.12.2003 | Werder Bremen [A-jeun] | - | FC St. Pauli [A-jeun] | 5:0 | ||||
| 13. Journée | 13.12.2003 | FC St. Pauli [A-jeun] | - | FC Carl Zeiss Jena [A-jeun] | 1:0 |
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