| 17. Journée | 01.03.2025 | Zbrojovka Brno | - | MFK Chrudim | 0:0 | ||||
| 18. Journée | 08.03.2025 | MFK Chrudim | - | Slavia Praha B | 0:1 | ||||
| 19. Journée | 16.03.2025 | Baník Ostrava B | - | MFK Chrudim | 1:0 |  |
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| 20. Journée | 29.03.2025 | MFK Chrudim | - | FK Varnsdorf | 2:1 |  |
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| 21. Journée | 06.04.2025 | AC Sparta Praha B | - | MFK Chrudim | 2:2 | |
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| 22. Journée | 12.04.2025 | MFK Chrudim | - | SFC Opava | 2:0 | |
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| 23. Journée | 16.04.2025 | MFK Chrudim | - | MFK Vyškov | 3:0 | |
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| 24. Journée | 19.04.2025 | FK MAS Táborsko | - | MFK Chrudim | 1:2 | ||||
| 25. Journée | 26.04.2025 | MFK Chrudim | - | SK Líšeň | 1:1 | |
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| 26. Journée | 04.05.2025 | Viktoria Žižkov | - | MFK Chrudim | 1:2 | ||||
| 27. Journée | 07.05.2025 | MFK Chrudim | - | 1. SK Prostějov | 1:3 | ||||
| 28. Journée | 11.05.2025 | Vysočina Jihlava | - | MFK Chrudim | 1:1 |
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