| 1er tour | 18.09.2008 | Slavia Praha | - | FC Vaslui | 0:0 | ||||
| 1er tour | 02.10.2008 | FC Vaslui | - | Slavia Praha | 1:1 | ||||
| Groupe F | 06.11.2008 | Slavia Praha | - | Aston Villa | 0:1 | ||||
| Groupe F | 27.11.2008 | MŠK Žilina | - | Slavia Praha | 0:0 |  |
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| Groupe F | 04.12.2008 | Slavia Praha | - | Hamburger SV | 0:2 | |
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| Groupe F | 17.12.2008 | AFC Ajax | - | Slavia Praha | 2:2 |
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