| 1. Journée | 20.08.2016 | Balzan FC | - | Mosta FC | 3:2 |  |
|||
| 2. Journée | 26.08.2016 | Mosta FC | - | Valletta FC | 0:1 | ||||
| 4. Journée | 17.09.2016 | Mosta FC | - | Gżira United | 2:1 |  |
|||
| 5. Journée | 22.09.2016 | Birkirkara FC | - | Mosta FC | 2:0 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2016 | Mosta FC | - | St. Andrews FC | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 30.09.2016 | Mosta FC | - | Hamrun Spartans | 2:5 | ||||
| 8. Journée | 15.10.2016 | Tarxien Rainbows | - | Mosta FC | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 05.11.2016 | Mosta FC | - | Pembroke Athleta FC | 0:3 | ||||
| 13. Journée | 27.11.2016 | Valletta FC | - | Mosta FC | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 04.12.2016 | Mosta FC | - | Hibernians FC | 0:2 | ||||
| 15. Journée | 10.12.2016 | Gżira United | - | Mosta FC | 3:0 |
Slovaquie