| 5. Journée | 27.08.2006 | Tescoma Zlín | - | Viktoria Plzeň | 1:2 |  |
|||
| 6. Journée | 10.09.2006 | Viktoria Plzeň | - | Sigma Olomouc | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 16.09.2006 | Baník Ostrava | - | Viktoria Plzeň | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 24.09.2006 | Viktoria Plzeň | - | Slavia Praha | 0:4 | ||||
| 9. Journée | 01.10.2006 | Dynamo České Budějovice | - | Viktoria Plzeň | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 14.10.2006 | Viktoria Plzeň | - | 1. FC Brno | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2006 | Viktoria Plzeň | - | FK SIAD Most | 1:1 | ||||
| 13. Journée | 04.11.2006 | 1. FC Slovácko | - | Viktoria Plzeň | 0:2 | ||||
| 14. Journée | 12.11.2006 | FK Jablonec 97 | - | Viktoria Plzeň | 2:1 | ||||
| 18. Journée | 11.03.2007 | Viktoria Plzeň | - | FK Mladá Boleslav | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 18.03.2007 | FK Teplice | - | Viktoria Plzeň | 1:2 |  |
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| 20. Journée | 01.04.2007 | Viktoria Plzeň | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 21. Journée | 08.04.2007 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Plzeň | 1:3 | ||||
| 22. Journée | 15.04.2007 | Viktoria Plzeň | - | Baník Ostrava | 0:1 | ||||
| 23. Journée | 18.04.2007 | Slavia Praha | - | Viktoria Plzeň | 0:1 | ||||
| 24. Journée | 22.04.2007 | Viktoria Plzeň | - | Dynamo České Budějovice | 2:2 |
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