| 1. Journée | 30.07.2006 | FK Teplice | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 2. Journée | 06.08.2006 | 1. FC Brno | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 13.08.2006 | Dynamo České Budějovice | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 4. Journée | 20.08.2006 | 1. FC Brno | - | Slavia Praha | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | Slovan Liberec | - | 1. FC Brno | 0:0 |  |
|||
| 6. Journée | 11.09.2006 | 1. FC Brno | - | Baník Ostrava | 2:1 | |
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| 7. Journée | 17.09.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Brno | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 23.09.2006 | 1. FC Slovácko | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 01.10.2006 | 1. FC Brno | - | FK SIAD Most | 1:1 | ||||
| 10. Journée | 14.10.2006 | Viktoria Plzeň | - | 1. FC Brno | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 23.10.2006 | 1. FC Brno | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 28.10.2006 | AC Sparta Praha | - | 1. FC Brno | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 05.11.2006 | 1. FC Brno | - | FK Jablonec 97 | 3:2 | ||||
| 14. Journée | 12.11.2006 | SK Kladno | - | 1. FC Brno | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 25.11.2006 | Tescoma Zlín | - | 1. FC Brno | 3:0 | ||||
| 18. Journée | 11.03.2007 | 1. FC Brno | - | Dynamo České Budějovice | 5:0 | ||||
| 19. Journée | 19.03.2007 | Slavia Praha | - | 1. FC Brno | 2:1 | |
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| 20. Journée | 01.04.2007 | 1. FC Brno | - | Slovan Liberec | 1:2 |
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