| 6. Journée | 10.09.2006 | Viktoria Plzeň | - | Sigma Olomouc | 2:0 |  |
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| 14. Journée | 11.11.2006 | AC Sparta Praha | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 15. Journée | 19.11.2006 | Sigma Olomouc | - | Tescoma Zlín | 3:0 | |
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| 16. Journée | 26.11.2006 | Dynamo České Budějovice | - | Sigma Olomouc | 2:0 | |
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| 19. Journée | 18.03.2007 | Slovan Liberec | - | Sigma Olomouc | 2:1 | |
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| 21. Journée | 08.04.2007 | Sigma Olomouc | - | Viktoria Plzeň | 1:3 | ||||
| 23. Journée | 19.04.2007 | Sigma Olomouc | - | SK Kladno | 2:0 | ||||
| 24. Journée | 22.04.2007 | 1. FC Slovácko | - | Sigma Olomouc | 1:0 | |
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| 25. Journée | 29.04.2007 | Sigma Olomouc | - | FK Jablonec 97 | 1:1 | ||||
| 26. Journée | 06.05.2007 | FK SIAD Most | - | Sigma Olomouc | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 09.05.2007 | Sigma Olomouc | - | FK Marila Příbram | 0:0 | |
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| 28. Journée | 13.05.2007 | FK Teplice | - | Sigma Olomouc | 2:2 | ||||
| 29. Journée | 21.05.2007 | Sigma Olomouc | - | AC Sparta Praha | 0:2 | ||||
| 30. Journée | 28.05.2007 | Tescoma Zlín | - | Sigma Olomouc | 1:1 |
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