| 3. Journée | 05.08.2006 | Jahn Regensburg | - | Wacker Burghausen II | 2:1 | ||||
| 9. Journée | 02.09.2006 | Wacker Burghausen II | - | 1. FC Bad Kötzting | 1:3 | ||||
| 28. Journée | 24.03.2007 | 1. FC Bad Kötzting | - | Wacker Burghausen II | 3:2 | ||||
| 29. Journée | 31.03.2007 | Wacker Burghausen II | - | TSV Großbardorf | 3:1 |  |
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| 30. Journée | 07.04.2007 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Wacker Burghausen II | 3:0 |  |
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| 32. Journée | 21.04.2007 | 1. SC Feucht | - | Wacker Burghausen II | 2:4 |
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