| 6. Journée | 25.08.2012 | SpVgg Unterhaching | - | VfB Stuttgart II | 0:3 | ||||
| 7. Journée | 29.08.2012 | VfB Stuttgart II | - | SV Babelsberg 03 | 2:1 | ||||
| 9. Journée | 14.09.2012 | VfB Stuttgart II | - | Chemnitzer FC | 0:1 | ||||
| 13. Journée | 06.10.2012 | VfB Stuttgart II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:2 | ||||
| 24. Journée | 02.02.2013 | Stuttgarter Kickers | - | VfB Stuttgart II | 3:0 | ||||
| 21. Journée | 05.02.2013 | VfB Stuttgart II | - | Kickers Offenbach | 1:0 |  |
|||
| 29. Journée | 09.03.2013 | VfB Stuttgart II | - | SV Darmstadt 98 | 0:2 | ||||
| 32. Journée | 06.04.2013 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | VfB Stuttgart II | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 13.04.2013 | VfB Stuttgart II | - | Hallescher FC | 3:0 | ||||
| 34. Journée | 20.04.2013 | VfB Stuttgart II | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 35. Journée | 27.04.2013 | VfL Osnabrück | - | VfB Stuttgart II | 2:0 | ||||
| 36. Journée | 03.05.2013 | VfB Stuttgart II | - | Arminia Bielefeld | 0:1 | ||||
| 37. Journée | 11.05.2013 | Alemannia Aachen | - | VfB Stuttgart II | 4:2 |  |
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| 38. Journée | 18.05.2013 | VfB Stuttgart II | - | Borussia Dortmund II | 0:1 |
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