| 1. Journée | 17.03.2006 | FK Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:0 |  |
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| 2. Journée | 26.03.2006 | FK Rostov | - | FK Moskva | 4:0 | ||||
| 3. Journée | 02.04.2006 | FK Moskva | - | Krylia Sovetov | 1:0 | ||||
| 4. Journée | 08.04.2006 | FK Moskva | - | Luch-Energiya Vladivostok | 2:1 | |
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| 5. Journée | 16.04.2006 | FK Moskva | - | Spartak Nalchik | 1:1 | |
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| 6. Journée | 23.04.2006 | Spartak Moskva | - | FK Moskva | 3:3 | |
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| 8. Journée | 07.05.2006 | Rubin Kazan | - | FK Moskva | 2:0 | |
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| 9. Journée | 14.05.2006 | FK Moskva | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 20.08.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Moskva | 2:2 |
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