| 6. Journée | 09.09.2006 | AC Sparta Praha | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 16.09.2006 | Tescoma Zlín | - | FK Marila Příbram | 1:0 |  |
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| 8. Journée | 24.09.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 9. Journée | 30.09.2006 | Tescoma Zlín | - | FK Jablonec 97 | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 11.11.2006 | Tescoma Zlín | - | Slavia Praha | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 11.03.2007 | FK SIAD Most | - | Tescoma Zlín | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 17.03.2007 | Tescoma Zlín | - | SK Kladno | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 07.04.2007 | Tescoma Zlín | - | AC Sparta Praha | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 15.04.2007 | FK Marila Příbram | - | Tescoma Zlín | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 18.04.2007 | Tescoma Zlín | - | FK Mladá Boleslav | 0:2 | ||||
| 25. Journée | 29.04.2007 | FK Teplice | - | Tescoma Zlín | 1:0 |  |
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| 26. Journée | 05.05.2007 | Tescoma Zlín | - | Baník Ostrava | 0:0 | ||||
| 27. Journée | 09.05.2007 | Slovan Liberec | - | Tescoma Zlín | 2:2 | ||||
| 29. Journée | 21.05.2007 | Slavia Praha | - | Tescoma Zlín | 2:1 | |
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| 30. Journée | 28.05.2007 | Tescoma Zlín | - | Sigma Olomouc | 1:1 |
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