| 1. Journée | 20.07.2024 | MFK Vyškov | - | 1. SK Prostějov | 0:0 |  |
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| 4. Journée | 04.08.2024 | Viktoria Žižkov | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 09.08.2024 | 1. SK Prostějov | - | FC Sellier & Bellot Vlašim | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 18.08.2024 | Baník Ostrava B | - | 1. SK Prostějov | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 23.08.2024 | 1. SK Prostějov | - | Vysočina Jihlava | 2:1 | ||||
| 8. Journée | 01.09.2024 | Slavia Praha B | - | 1. SK Prostějov | 2:2 | |
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| 11. Journée | 28.09.2024 | 1. SK Prostějov | - | FK Varnsdorf | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 02.10.2024 | 1. SK Prostějov | - | Zbrojovka Brno | 3:1 | ||||
| 12. Journée | 06.10.2024 | AC Sparta Praha B | - | 1. SK Prostějov | 5:2 | ||||
| 14. Journée | 26.10.2024 | SK Líšeň | - | 1. SK Prostějov | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 08.11.2024 | 1. SK Prostějov | - | Sigma Olomouc B | 2:0 | ||||
| 17. Journée | 03.03.2025 | FC Zlín | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | |
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| 20. Journée | 28.03.2025 | 1. SK Prostějov | - | Baník Ostrava B | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 04.04.2025 | Vysočina Jihlava | - | 1. SK Prostějov | 3:0 |
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