| 1er tour | 16.09.1999 | FK Bodø/Glimt | - | Werder Bremen | 0:5 | ||||
| 1er tour | 30.09.1999 | Werder Bremen | - | FK Bodø/Glimt | 1:1 | ||||
| 2e tour | 21.10.1999 | Werder Bremen | - | Viking FK | 0:0 | ||||
| 2e tour | 04.11.1999 | Viking FK | - | Werder Bremen | 2:2 | ||||
| 3e tour | 25.11.1999 | Olympique Lyonnais | - | Werder Bremen | 3:0 | ||||
| 3e tour | 07.12.1999 | Werder Bremen | - | Olympique Lyonnais | 4:0 |  |
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| tour des 16 | 09.03.2000 | Werder Bremen | - | Parma AC | 3:1 | |
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| Quarts de finale | 16.03.2000 | Arsenal FC | - | Werder Bremen | 2:0 | ||||
| Quarts de finale | 23.03.2000 | Werder Bremen | - | Arsenal FC | 2:4 | |
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