| 1. Journée | 04.08.1999 | Bayer Leverkusen II | - | SC Verl | 2:2 | ||||
| 2. Journée | 08.08.1999 | Preußen Münster | - | Bayer Leverkusen II | 3:3 |  |
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| 3. Journée | 11.08.1999 | FK Pirmasens | - | Bayer Leverkusen II | 2:2 | |
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| 4. Journée | 14.08.1999 | Bayer Leverkusen II | - | SC 07 Idar-Oberstein | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 22.08.1999 | Rot-Weiss Essen | - | Bayer Leverkusen II | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 29.08.1999 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FC Saarbrücken | 0:1 | ||||
| 11. Journée | 03.10.1999 | LR Ahlen | - | Bayer Leverkusen II | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 10.10.1999 | Bayer Leverkusen II | - | Eintracht Trier | 1:1 | |
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| 19. Journée | 05.12.1999 | FSV Salmrohr | - | Bayer Leverkusen II | 0:1 | |
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| 20. Journée | 12.12.1999 | SC Verl | - | Bayer Leverkusen II | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 19.12.1999 | Bayer Leverkusen II | - | Preußen Münster | 0:1 | ||||
| 22. Journée | 06.02.2000 | Bayer Leverkusen II | - | FK Pirmasens | 1:2 | ||||
| 23. Journée | 13.02.2000 | SC 07 Idar-Oberstein | - | Bayer Leverkusen II | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 27.02.2000 | 1. FC Saarbrücken | - | Bayer Leverkusen II | 3:0 |
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