| 1. Journée | 02.08.1998 | SpVgg Erkenschwick | - | Bayer Leverkusen II | 2:4 |  |
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| 2. Journée | 11.08.1998 | Bayer Leverkusen II | - | Wuppertaler SV | 3:3 | ||||
| 3. Journée | 16.08.1998 | LR Ahlen | - | Bayer Leverkusen II | 1:3 | |
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| 4. Journée | 23.08.1998 | Bayer Leverkusen II | - | Eintracht Trier | 1:0 |  |
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| 6. Journée | 06.09.1998 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FC Saarbrücken | 1:1 | ||||
| 5. Journée | 09.09.1998 | Borussia Dortmund II | - | Bayer Leverkusen II | 0:3 | ||||
| 7. Journée | 13.09.1998 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Bayer Leverkusen II | 4:3 | ||||
| 8. Journée | 20.09.1998 | Bayer Leverkusen II | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | |
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| 9. Journée | 27.09.1998 | Sportfreunde Siegen | - | Bayer Leverkusen II | 1:2 | |
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| 10. Journée | 04.10.1998 | Bayer Leverkusen II | - | FC Remscheid | 5:0 | |
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| 11. Journée | 09.10.1998 | Alemannia Aachen | - | Bayer Leverkusen II | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 18.10.1998 | Bayer Leverkusen II | - | FSV Salmrohr | 4:1 | ||||
| 15. Journée | 07.11.1998 | Bayer Leverkusen II | - | SC Verl | 0:3 | ||||
| 16. Journée | 15.11.1998 | SV 07 Elversberg | - | Bayer Leverkusen II | 2:0 |
Allemagne