| 1er tour | 24.01.2006 | Colo-Colo | - | Deportivo Guadalajara | 1:3 | ||||
| Groupe 1 | 09.02.2006 | Cienciano | - | Deportivo Guadalajara | 0:1 | ||||
| Groupe 1 | 13.04.2006 | Caracas FC | - | Deportivo Guadalajara | 0:0 | ||||
| Groupe 1 | 21.04.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Cienciano | 0:0 | ||||
| tour des 16 | 03.05.2006 | Santa Fe | - | Deportivo Guadalajara | 3:1 |  |
Mexique