| 12. Journée | 05.07.2008 | Spartak Nalchik | - | Shinnik Yaroslavl | 2:1 |  |
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| 13. Journée | 12.07.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | Krylia Sovetov | 0:0 | |
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| 14. Journée | 23.07.2008 | FK Saturn | - | Shinnik Yaroslavl | 4:0 |  |
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| 17. Journée | 09.08.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | Luch-Energiya Vladivostok | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 17.08.2008 | Zenit St. Petersburg | - | Shinnik Yaroslavl | 1:3 | ||||
| 19. Journée | 23.08.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Tom Tomsk | 0:1 | ||||
| 20. Journée | 29.08.2008 | FK Khimki | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 18.10.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | Rubin Kazan | 0:2 | ||||
| 27. Journée | 03.11.2008 | Krylia Sovetov | - | Shinnik Yaroslavl | 4:0 | ||||
| 29. Journée | 16.11.2008 | Terek Grozny | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 30. Journée | 22.11.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | CSKA Moskva | 1:0 |
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