| Groupe F | 01.10.2009 | Dinamo Bucureşti | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| Groupe F | 22.10.2009 | Panathinaikos | - | Sturm Graz | 1:0 | ||||
| Groupe F | 05.11.2009 | Sturm Graz | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| Groupe F | 03.12.2009 | Galatasaray | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| Groupe F | 16.12.2009 | Panathinaikos | - | Dinamo Bucureşti | 3:0 | ||||
| 2e tour | 18.02.2010 | Panathinaikos | - | AS Roma | 3:2 | ||||
| 2e tour | 25.02.2010 | AS Roma | - | Panathinaikos | 2:3 |  |
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| tour des 16 | 11.03.2010 | Panathinaikos | - | Standard Liège | 1:3 |  |
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| tour des 16 | 18.03.2010 | Standard Liège | - | Panathinaikos | 1:0 |
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