| 4. Journée | 14.08.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2016 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Lok Leipzig | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 16.10.2016 | Berliner AK 07 | - | SV Babelsberg 03 | 2:0 | ||||
| 11. Journée | 23.10.2016 | SV Babelsberg 03 | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 4:1 | ||||
| 12. Journée | 30.10.2016 | Hertha BSC II | - | SV Babelsberg 03 | 2:2 | ||||
| 14. Journée | 19.11.2016 | Energie Cottbus | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 | ||||
| 16. Journée | 02.12.2016 | SV Babelsberg 03 | - | FSV 63 Luckenwalde | 2:0 |  |
|||
| 25. Journée | 17.03.2017 | SV Babelsberg 03 | - | TSG Neustrelitz | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 26.03.2017 | SV Babelsberg 03 | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 07.04.2017 | SV Babelsberg 03 | - | Berliner AK 07 | 1:0 | ||||
| 29. Journée | 19.04.2017 | SV Babelsberg 03 | - | Hertha BSC II | 1:3 | ||||
| 30. Journée | 23.04.2017 | BFC Dynamo | - | SV Babelsberg 03 | 2:1 | ||||
| 31. Journée | 28.04.2017 | SV Babelsberg 03 | - | Energie Cottbus | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 07.05.2017 | ZFC Meuselwitz | - | SV Babelsberg 03 | 0:2 |
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