| 31. Journée | 11.02.2017 | Gillingham FC | - | Port Vale FC | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 14.02.2017 | Gillingham FC | - | Chesterfield FC | 1:1 | ||||
| 33. Journée | 18.02.2017 | Coventry City | - | Gillingham FC | 2:1 | ||||
| 26. Journée | 21.02.2017 | Gillingham FC | - | AFC Wimbledon | 2:2 | ||||
| 34. Journée | 25.02.2017 | Gillingham FC | - | Southend United | 2:1 | ||||
| 35. Journée | 28.02.2017 | Swindon Town | - | Gillingham FC | 3:1 | ||||
| 36. Journée | 04.03.2017 | Bury FC | - | Gillingham FC | 1:2 | ||||
| 37. Journée | 11.03.2017 | Gillingham FC | - | Scunthorpe United | 3:2 | ||||
| 38. Journée | 14.03.2017 | Gillingham FC | - | Bolton Wanderers | 0:4 | ||||
| 39. Journée | 18.03.2017 | Rochdale AFC | - | Gillingham FC | 4:1 | ||||
| 40. Journée | 25.03.2017 | Gillingham FC | - | Peterborough United | 0:1 | ||||
| 41. Journée | 01.04.2017 | Milton Keynes Dons | - | Gillingham FC | 3:2 | ||||
| 42. Journée | 08.04.2017 | Gillingham FC | - | Millwall FC | 1:1 |  |
|||
| 43. Journée | 14.04.2017 | Gillingham FC | - | Bristol Rovers | 3:1 | ||||
| 44. Journée | 17.04.2017 | Charlton Athletic | - | Gillingham FC | 3:0 | |
|||
| 45. Journée | 22.04.2017 | Gillingham FC | - | Fleetwood Town | 2:3 | ||||
| 46. Journée | 30.04.2017 | Northampton Town | - | Gillingham FC | 0:0 |
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