| 6. Journée | 02.09.2006 | Rot Weiss Ahlen | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 9. Journée | 24.09.2006 | Borussia Dortmund II | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 26. Journée | 17.03.2007 | VfL Osnabrück | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 27. Journée | 24.03.2007 | Borussia Dortmund II | - | Fortuna Düsseldorf | 1:0 |  |
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| 30. Journée | 07.04.2007 | 1. FC Magdeburg | - | Borussia Dortmund II | 2:2 | ||||
| 31. Journée | 13.04.2007 | Borussia Dortmund II | - | Wuppertaler SV | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 28.04.2007 | VfB Lübeck | - | Borussia Dortmund II | 1:3 | |
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| 34. Journée | 06.05.2007 | Borussia Dortmund II | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 35. Journée | 13.05.2007 | Hertha BSC II | - | Borussia Dortmund II | 0:3 | |
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| 37. Journée | 26.05.2007 | SV Wilhelmshaven | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 38. Journée | 02.06.2007 | Borussia Dortmund II | - | Bayer Leverkusen II | 2:0 | |
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