| 6. Journée | 11.04.2021 | Tallinna JK Legion | - | FC Flora | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 17.04.2021 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 5:0 | ||||
| 8. Journée | 20.04.2021 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 3:3 |  |
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| 9. Journée | 25.04.2021 | FC Flora | - | FCI Levadia | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 30.04.2021 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 0:4 | ||||
| 14. Journée | 19.05.2021 | FCI Levadia | - | FC Flora | 2:4 | ||||
| 17. Journée | 16.07.2021 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 0:4 | ||||
| 20. Journée | 14.08.2021 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 27.10.2021 | FC Flora | - | JK Tammeka | 9:0 |
Estonie