| 7. Journée | 17.04.2016 | FK Trakai | - | FK Atlantas | 2:0 | ||||
| 8. Journée | 21.04.2016 | FC Stumbras | - | FK Atlantas | 2:3 | ||||
| 9. Journée | 27.04.2016 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 1:2 | ||||
| 16. Journée | 24.06.2016 | FK Sūduva | - | FK Atlantas | 3:3 | ||||
| 18. Journée | 19.07.2016 | FK Jonava | - | FK Atlantas | 1:2 |  |
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| 19. Journée | 27.07.2016 | FK Atlantas | - | Kauno Žalgiris | 1:1 |
Lituanie