| 1. Journée | 27.07.2024 | SC Paderborn 07 II | - | 1. FC Düren | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 20.09.2024 | Türkspor Dortmund | - | SC Paderborn 07 II | ann. |  |
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| 15. Journée | 08.11.2024 | FC Schalke 04 II | - | SC Paderborn 07 II | 0:4 | ||||
| 17. Journée | 30.11.2024 | 1. FC Bocholt | - | SC Paderborn 07 II | 1:2 | ||||
| 23. Journée | 22.02.2025 | SC Paderborn 07 II | - | Sportfreunde Lotte | 1:3 | ||||
| 25. Journée | 09.03.2025 | SC Paderborn 07 II | - | Türkspor Dortmund | ann. | ||||
| 26. Journée | 15.03.2025 | Rot-Weiß Oberhausen | - | SC Paderborn 07 II | 2:0 | ||||
| 27. Journée | 22.03.2025 | SC Paderborn 07 II | - | Eintracht Hohkeppel | 3:0 | ||||
| 28. Journée | 04.04.2025 | SC Paderborn 07 II | - | KFC Uerdingen 05 | ann. | ||||
| 29. Journée | 13.04.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | SC Paderborn 07 II | 3:1 | ||||
| 30. Journée | 19.04.2025 | SC Paderborn 07 II | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 31. Journée | 26.04.2025 | SC Wiedenbrück | - | SC Paderborn 07 II | 2:1 |
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