| 21. Journée | 10.01.2006 | FC Istres | - | FC Sète | 1:0 |  |
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| 22. Journée | 13.01.2006 | CS Sedan | - | FC Istres | 3:1 | |
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| 23. Journée | 20.01.2006 | FC Istres | - | Clermont Foot Auvergne | 1:1 | ||||
| 24. Journée | 06.02.2006 | FC Istres | - | FC Lorient | 2:1 | |
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| 25. Journée | 10.02.2006 | Dijon FCO | - | FC Istres | 2:0 | ||||
| 26. Journée | 17.02.2006 | FC Istres | - | Grenoble Foot 38 | 2:1 | |
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| 27. Journée | 24.02.2006 | SM Caen | - | FC Istres | 1:0 |  |
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| 28. Journée | 03.03.2006 | FC Istres | - | LB Châteauroux | 2:1 | |
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| 29. Journée | 10.03.2006 | FC Gueugnon | - | FC Istres | 2:0 | ||||
| 30. Journée | 17.03.2006 | FC Istres | - | Montpellier HSC | 1:0 | |
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| 31. Journée | 24.03.2006 | SC Bastia | - | FC Istres | 3:0 | ||||
| 32. Journée | 31.03.2006 | FC Istres | - | Amiens SC | 1:0 | |
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| 33. Journée | 07.04.2006 | Stade Brestois 29 | - | FC Istres | 0:0 | |
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| 34. Journée | 14.04.2006 | FC Istres | - | US Créteil-Lusitanos | 0:1 | |
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| 35. Journée | 21.04.2006 | Valenciennes FC | - | FC Istres | 1:0 | ||||
| 37. Journée | 05.05.2006 | Havre AC | - | FC Istres | 0:0 | ||||
| 38. Journée | 12.05.2006 | FC Istres | - | Stade Lavallois | 2:1 | |
France