| 1. Journée | 18.07.2016 | TSV 1860 München II | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:1 | ||||
| 2. Journée | 22.07.2016 | SpVgg Bayreuth | - | TSV 1860 München II | 4:2 |  |
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| 6. Journée | 13.08.2016 | TSV 1860 München II | - | FC Memmingen | 1:1 | ||||
| 15. Journée | 15.10.2016 | Wacker Burghausen | - | TSV 1860 München II | 0:1 |  |
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| 9. Journée | 19.10.2016 | FC Augsburg II | - | TSV 1860 München II | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 04.11.2016 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV 1860 München II | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 12.11.2016 | TSV 1860 München II | - | SpVgg Bayreuth | 1:1 | |
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| 20. Journée | 19.11.2016 | TSV 1860 Rosenheim | - | TSV 1860 München II | 2:0 | ||||
| 21. Journée | 25.11.2016 | TSV 1860 München II | - | VfR Garching | 2:1 |
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