| 1. Journée | 22.01.2006 | Atlante | - | Dorados de Sinaloa | 0:0 | ||||
| 2. Journée | 29.01.2006 | Santos Laguna | - | Atlante | 3:4 |  |
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| 4. Journée | 05.02.2006 | Club Necaxa | - | Atlante | 1:2 | |
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| 5. Journée | 11.02.2006 | Atlante | - | Club San Luis | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 18.02.2006 | Veracruz (old) | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 23.02.2006 | Atlante | - | Deportivo Guadalajara | 2:0 |  |
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| 7. Journée | 26.02.2006 | Atlante | - | Cruz Azul | 1:2 | ||||
| 8. Journée | 05.03.2006 | CF Monterrey | - | Atlante | 3:0 | ||||
| 9. Journée | 12.03.2006 | Atlante | - | CF Pachuca | 1:2 | ||||
| 10. Journée | 16.03.2006 | Monarcas Morelia | - | Atlante | 0:2 | ||||
| 11. Journée | 19.03.2006 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 26.03.2006 | UAG Tecos | - | Atlante | 0:2 | |
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| 13. Journée | 02.04.2006 | Atlante | - | Deportivo Toluca | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 16.04.2006 | Atlante | - | Pumas UNAM | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 23.04.2006 | Atlante | - | CF América | 1:0 | |
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| 17. Journée | 01.05.2006 | UANL Tigres | - | Atlante | 0:2 | |
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