| 2. Journée | 29.01.2016 | Club Rubio Ñu | - | Club Nacional | 2:1 |  |
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| 5. Journée | 14.02.2016 | Club Nacional | - | Libertad | 1:3 | ||||
| 6. Journée | 20.02.2016 | Club Nacional | - | River Plate | 0:0 | |
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| 7. Journée | 27.02.2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Nacional | 2:4 |  |
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| 8. Journée | 03.03.2016 | Club Nacional | - | General Díaz | 1:3 | |
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| 9. Journée | 06.03.2016 | Cerro Porteño | - | Club Nacional | 1:2 | ||||
| 10. Journée | 12.03.2016 | Club Nacional | - | Sportivo Luqueño | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 20.03.2016 | General Caballero ZC | - | Club Nacional | 1:3 | |
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| 12. Journée | 03.04.2016 | Guaraní | - | Club Nacional | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 07.04.2016 | Club Nacional | - | Club Rubio Ñu | 3:1 | ||||
| 14. Journée | 10.04.2016 | Club Olimpia | - | Club Nacional | 3:1 | ||||
| 16. Journée | 21.04.2016 | Libertad | - | Club Nacional | 4:3 | ||||
| 17. Journée | 25.04.2016 | River Plate | - | Club Nacional | 1:3 | ||||
| 18. Journée | 30.04.2016 | Club Nacional | - | Deportivo Capiatá | 0:1 | ||||
| 19. Journée | 05.05.2016 | General Díaz | - | Club Nacional | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 14.05.2016 | Sportivo Luqueño | - | Club Nacional | 3:2 | ||||
| 22. Journée | 22.05.2016 | Club Nacional | - | General Caballero ZC | 2:3 |
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