| 6. Journée | 17.09.2016 | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | - | 1. FC Nürnberg [A-jeun] | 3:2 | ||||
| 7. Journée | 25.09.2016 | FC Augsburg [A-jeun] | - | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | 1:0 |  |
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| 8. Journée | 16.10.2016 | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | - | FC Ingolstadt 04 [A-jeun] | 1:0 |  |
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| 9. Journée | 22.10.2016 | VfB Stuttgart [A-jeun] | - | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | 3:2 | ||||
| 10. Journée | 30.10.2016 | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | - | SpVgg Greuther Fürth [A-jeun] | 1:2 | ||||
| 11. Journée | 05.11.2016 | Eintracht Frankfurt [A-jeun] | - | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | 0:2 |  |
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| 14. Journée | 04.12.2016 | TSV 1860 München [A-jeun] | - | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | 0:2 | ||||
| 15. Journée | 10.12.2016 | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | - | 1899 Hoffenheim [A-jeun] | 3:1 | ||||
| 16. Journée | 05.02.2017 | 1. FSV Mainz 05 [A-jeun] | - | Karlsruher SC [A-jeun] | 0:1 |
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